Насекомые, как и другие живые организмы, могут поражаться болезнями. Возбудителями таких болезней являются различные микроорганизмы: бактерии, грибы, вирусы. В нашей стране изготавливают препараты, уничтожающие многих вредных насекомых, например энтобактерии, дендробациллин для борьбы с гусеницами вредных бабочек и др. Преимущество бактериальных препаратов — их относительная безвредность для человека, теплокровных животных, полезных насекомых и растений.

Полезные микроорганизмы применяют и против грибных болезней растений. Так, для борьбы с американской мучнистой росой крыжовника успешно используют настой коровьего навоза или прелого сена. В нем развиваются бактерии, уничтожающие грибницу (мицелий) мучнистой росы.

Особенно большой интерес представляют исследования, направленные на изучение возможности применения в практике защиты растений антибиотиков (фитобактериомицин, трихотецин) для борьбы с бактериальными и грибными заболеваниями плодовых, ягодных и других растений, а также бактериальных препаратов для борьбы с мышевидными грызунами.